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Variabilidad genética del nematodo Metaparasitylenchus hypothenemi parásito de la broca del café / Marina Simota Ruiz

Por: Símota Ruiz, Marina. Maestra [autora].
Castillo Vera, Alfredo [director] | Mikery Pacheco, Oscar Fernando [asesor] | Cisneros Hernández, Juan [asesor].
Tipo de material: Tesis
 impreso(a) 
 Tesis impreso(a) Editor: Tapachula de Córdova y Ordóñez, Chiapas, México: El Colegio de la Frontera Sur, 2020Descripción: 54 hojas : fotografías, ilustraciones, mapas ; 28 centímetros.Tema(s): Broca del cafeto | Metaparasitylenchus hypothenemi | Nemátodos como agentes biológicos para el control de plagas | ADN mitocondrial | Variación genética | Factores ambientalesTema(s) en inglés: Coffee berry borer | Metaparasitylenchus hypothenemi | Nematoda as biological pest control agents | DNA mitochondrial | Genetic variation | Environmental factorsDescriptor(es) geográficos: Región Soconusco (Chiapas, México) Clasificación: TE/633.739760972 / S5 Nota de disertación: Tesis Maestra en Ciencias en Recursos Naturales y Desarrollo Rural El Colegio de la Frontera Sur 2020 Nota de bibliografía: Incluye bibliografía Entomología TropicalNúmero de sistema: 60511Contenidos:Mostrar Resumen:
Español

El nematodo Metaparasitylenchus hypothenemi (Tylenchida: Allantonematidae) es un parásito de la broca del café Hypothenemus hampei (Coleoptera: Curculionidae: Scolytinae) en México y Guatemala. En esta investigación, nuestros objetivos fueron estimar la variabilidad genética de las poblaciones de M. hypothenemi, así como estimar la filogenia intra e inter-específica y determinar el potencial del gen COI para identificar al nematodo. Para ello, se colectaron adultos de la broca del café en 18 localidades de la región Soconusco, Chiapas; de los cuales, se obtuvieron los nematodos. Se utilizaron cinco hembras adultas de M. hypothenemi por cada localidad para realizar la extracción de ADN, amplificación y secuenciación del fragmento de 648 pb del gen COI. Se analizaron un total de 76 secuencias, dando como resultado 6 haplotipos, de los cuales, el haplotipo H1 fue el más frecuente y el probable ancestral. Los valores más altos de diversidad genética se registraron en las poblaciones de Salvador Urbina, La Alianza y Los Cacaos y se observó alta diferenciación genética y flujo genético restringido entre poblaciones (FST=0.66, Nm= 0.5, p<0.001). El análisis filogenético de máxima verosimilitud reveló dos linajes bien diferenciados (100 % bootstrap). Estos resultados sugieren que la variación y diferenciación genética entre poblaciones de M. hypothenemi son afectadas por el distanciamiento geográfico y probablemente con procesos adaptativos mediados por factores ambientales locales como la fragmentación del paisaje, el clima y la historia evolutiva. Además, se plantea la posibilidad de que M. hypothenemi esté constituida por dos linajes. Finalmente, se confirma la viabilidad de las secuencias del gen COI para identificar al nematodo M. hypothenemi y el potencial de esta herramienta para estudiar sus poblaciones desde una perspectiva molecular.

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Tesis ECOSUR (TE)
ECOSUR TE 633.739760972 S5 Disponible ECO020014065

Tesis Maestra en Ciencias en Recursos Naturales y Desarrollo Rural El Colegio de la Frontera Sur 2020

Incluye bibliografía

Resumen.. Capítulo 1.. 1.- Introducción.. 1.1.- Generalidades de Metaparasitylenchus hypothenemi.. 1. 1. 1.- Características de la hembra fertilizada de vida libre (HFV).. 1. 1 .2.- Ciclo de vida y modo de acción.. 1. 1. 3.- Distribución.. 1. 2.- ADN mitocondrial (ADNmt) y el gen Citocromo Oxidasa Subunidad I (COI).. 1.3.- Código de Barras de la Vida (Barcode of Life Data Systems; BOLD).. 2.- Justificación.. 3.- Pregunta de investigación.. 4.- Hipótesis.. 5.- Objetivos.. 5.1- Objetivo general.. 5.2- Objetivos específicos.. Capítulo 2.- “Genetic Variability of the Coffee Berry Borer Parasitic Nematode Metaparasitylenchus hypothenemi (Tylenchida: Allantonematidae) using COI Sequences”.. Capítulo 3.- Conclusiones.. Literatura citada

El nematodo Metaparasitylenchus hypothenemi (Tylenchida: Allantonematidae) es un parásito de la broca del café Hypothenemus hampei (Coleoptera: Curculionidae: Scolytinae) en México y Guatemala. En esta investigación, nuestros objetivos fueron estimar la variabilidad genética de las poblaciones de M. hypothenemi, así como estimar la filogenia intra e inter-específica y determinar el potencial del gen COI para identificar al nematodo. Para ello, se colectaron adultos de la broca del café en 18 localidades de la región Soconusco, Chiapas; de los cuales, se obtuvieron los nematodos. Se utilizaron cinco hembras adultas de M. hypothenemi por cada localidad para realizar la extracción de ADN, amplificación y secuenciación del fragmento de 648 pb del gen COI. Se analizaron un total de 76 secuencias, dando como resultado 6 haplotipos, de los cuales, el haplotipo H1 fue el más frecuente y el probable ancestral. Los valores más altos de diversidad genética se registraron en las poblaciones de Salvador Urbina, La Alianza y Los Cacaos y se observó alta diferenciación genética y flujo genético restringido entre poblaciones (FST=0.66, Nm= 0.5, p<0.001). El análisis filogenético de máxima verosimilitud reveló dos linajes bien diferenciados (100 % bootstrap). Estos resultados sugieren que la variación y diferenciación genética entre poblaciones de M. hypothenemi son afectadas por el distanciamiento geográfico y probablemente con procesos adaptativos mediados por factores ambientales locales como la fragmentación del paisaje, el clima y la historia evolutiva. Además, se plantea la posibilidad de que M. hypothenemi esté constituida por dos linajes. Finalmente, se confirma la viabilidad de las secuencias del gen COI para identificar al nematodo M. hypothenemi y el potencial de esta herramienta para estudiar sus poblaciones desde una perspectiva molecular. spa

Entomología Tropical

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