Evaluación de la germinación in situ de semillas de Oncidium poikilostalix (Orchidaceae) en dos cafetales de la región del Soconusco, Chiapas / Alejandra López Pastrana

Tesis Maestra en Ciencias en Recursos Naturales y Desarrollo Rural El Colegio de la Frontera Sur 2018

Incluye bibliografía

I. Resumen.. II. Introducción.. 2.1 Generalidades de la familia Orchidaceae.. 2.2 Conservación in situ de orquídeas.. 2.3 Relación orquídeas - hongos endófitos formadores de micorrizas.. 2.4 Herramientas moleculares para hongos.. 2.5 Orquídeas en cafetales.. III. Antecedentes.. IV. Justificación.. V. Hipótesis.. VI. Objetivos.. VII. Metodología.. 7.1 Sitios de estudio.. 7.2 Descripción de los sitios.. 7.3 Elaboración de paquetes de tela.. 7.4 Colecta de material biológico.. 7.5 Siembra in situ.. 7.6 Muestreo destructivo mensual de paquetes.. 7.7 Desinfección y observación de los paquetes.. 7.8 Desarrollo de semillas en los paquetes.. 7.9 Aislamiento fúngico de las semillas de los paquetes.. 7.10 Almacenamiento fúngico.. 7.11 Análisis estadístico.. 7.12 Colecta de muestras de corteza.. 7.13 Extracción de ADN.. 7.14 Análisis metagenómico.. VIII. Resultados.. 8.1 Desarrollo de semillas in situ.. 8.2 Etapas de desarrollo en los muestreos..8.3 Desarrollo de protocormos en micrositios.. 8.4 Semillas que germinaron (simbiosis con hongo.. 8.5 Análisis metagenómico de la distribución de hongos en los micrositios.. IX. Discusión.. 9.1 Germinación in situ.. 9.2. Distribución hongos con respecto al análisis metagenómico.. X. Conclusiones.. XI. Literatura Citada.. XII. Anexo 1.. 12.1 Protocolo de extracción de ácidos nucleicos totales basado en CTAB.. 12.2 Artículo sometido a PLOS ONE

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Se ha encontrado que ciertas especies de orquídeas epífitas, especialmente las miniaturas, han logrado adaptarse a los agroecosistemas de café arábica, siendo una opción de conservación para esta familia, dado que sus ecosistemas naturales han sido severamente reducidos por diferentes actividades antropogénicas. En este estudio se evalúo el proceso de germinación in situ de semillas de la especie de orquídea epífita miniatura Oncidium poikilostalix de junio a noviembre del 2017, por empaquetamiento de sus semillas en pequeñas bolsas de tela. Se llevaron a dos sitios de cafetales correspondientes a la región del Soconusco, Chiapas y fueron anclados a cuatro micrositios de árboles y cafetos: ramillete, rama, tronco alto y tronco bajo. Mensualmente, se realizaron muestreos destructivos de los paquetes para analizar las etapas de pre-germinación y germinación de las semillas en los sitios, cafeto y árbol, y micrositios. Además, se realizó un análisis metagenómico de cortezas de los cafetos y árboles, pertenecientes a la misma área de anclaje de los paquetes de semillas, para examinar la diversidad fúngica relacionada, primero con los micrositios, y luego con las sucesivas etapas de desarrollo de las semillas de O. poikilostalix. Debido a su complejidad multifactorial, para el análisis de datos se realizaron dos modelos estadísticos: un Modelo Mixto Generalizado ajustado mediante Máxima Verosimilitud y un Modelo Mixto Generalizado ajustado con el Método Bayesiano. Pese al corto periodo de los paquetes en campo, se encontró que una proporción de las semillas alcanzó la fase de pre-germinación y en otras hubo indicios de germinación. Entre los 240 paquetes anclados en los dos sitios, se obtuvo siete protocormos y una plántula. Tanto el análisis estadístico como el metagenómico indican diferencias significativas a nivel de micrositio, siendo, rama y tronco alto, los micrositios más favorables para la pre-germinación y germinación de O. poikilostalix spa

Manejo y Conservación de Recursos Naturales