Ecología molecular / Luis E. Eguiarte, Valeria Souza, Xitlali Aguirre (compiladores)

Incluye bibliografía e índice

Índice.. Introducción a la Ecología Molecular.. Agradecimientos.. PRIMERA PARTE. TEORÍA.. Capítulo 1. La selección natural a nivel molecular.. Tipos de selección.. The neutral expectation.. Adaptación a nivel molecular.. La selección a nivel genómico.. Bibliografía.. Capítulo 2. Flujo génico: métodos para estimarlo y marcadores moleculares.. Métodos directos.. Métodos indirectos.. Métodos genealógicos.. Bibliografía.. Capítulo 3. Tamaño efectivo de la población.. ¿Qué significa el tamaño efectivo?.. Métodos de estimación directos.. Métodos ecológicos y demográficos.. Métodos indirectos.. Métodos de máxima verosimilitud y coalescencia.. Aplicaciones.. Conclusión.. Bibliografía.. Capítulo 4.. Reconstrucción de la historia de cambio de los caracteres.. Árboles, genes y organismos.. Homología y alineación.. Modelos de sustitución.. Secuencias no alineables y métodos que no requieren alineación.. Métodos de estimación de filogenias.. Evaluación estadística de árboles.. Métodos que pueden colocar OTUs contemporáneos en nodos internos y otras novedades.. Bibliografía.. SEGUNDA PARTE. TEMAS FUNDAMENTALES DE LA ECOLOGÍA MOLECULAR.. Capítulo 5. Los análisis de paternidad, ¿para qué nos sirven?.. La teoría y los métodos.. Aplicación en animales.. Aplicación en plantas.. Conclusión.. Bibliografía.. Capítulo 6. La estimación de la endogamia y la relación entre la tasa de fecundación cruzada y los sistemas reproductivos en plantas con flores: una interpretación de su significado evolutivo.. Las distintas formas de medir la endogamia.. Estimaciones de la tasa de fecundación cruzada en poblaciones naturales de angiospermas.. Bibliografía

Capítulo 7. La clonalidad y sus efectos en la biología de poblaciones.. Organización jerárquica en plantas clonales y definiciones operativas.. Tipos de clonación y frecuencia de clonalidad en las plantas.. Ventajas y desventajas de la clonalidad.. Demografía: estructura y dinámica.. Distribución espacial de individuos en especies clonales y frecuencia de reclutamiento clonal en las poblaciones.. Adecuación en plantas clonales.. Estructura y variación genética en especies de plantas clonales.. Análisis demográfico-genético.. Discusión y consideraciones finales.. Bibliografía.. Capítulo 8. Ecología molecular de la conservación.. Un poco de historia.. Pero, ¿qué relación guardan la genética y la conservación?.. Especies en peligro, ¿a quién hay que proteger?.. Principios básicos en genética de la conservación.. Los enfoques actuales de la genética de la conservación.. Conclusiones y perspectivas.. Bibliografía.. TERCERA PARTE. LA ECOLOGÍA MOLECULAR DE LOS MICROORGANISMOS.. Capítulo 9 . La recombinación: relevancia evolutiva y métodos de estimación, con énfasis en microorganismos.. Mecanismos de la recombinación en eucariontes.. Mecanismos de la recombinación en procariontes.. Consecuencias de la recombinación.. Las poblaciones microbianas: clonalidad vs. panmixia.. Ejemplos de recombinación en bacterias.. Ejemplos de recombinación en hongos filamentosos.. Detectores y estimadores de la recombinación.. Estimación de la recombinación.. Consideraciones finales.. Bibliografía.. Capítulo 10 . La especie como unidad evolutiva: uso de marcadores moleculares para su reconocimiento y delimitación, con especial énfasis en microorganismos.. De lo natural a lo artificial y de lo universal a lo particular.. Limitaciones de cada método para reconocer y delimitar unidades evolutivas

El concepto de especie en microorganismos, un problema aún no resuelto.. Consideraciones finales.. Bibliografía.. Capítulo 11. Ecología evolutiva de bacterias y el concepto de especie: el caso de los rizobios.. La interacción rizobios-leguminosas.. Genética de poblaciones y evolución en bacterias.. Tres estudios de caso con rizobios.. Conclusiones.. Bibliografía.. Capítulo 12. Ecología molecular en el estudio de comunidades bacterianas.. El problema: comunidades y diversidad bacteriana, microorganismos cultivables y no cultivables.. ¿Cómo mejorar la recuperación en cultivo?.. ¿Qué hacer con los no cultivables? Métodos moleculares y otros métodos.. Métodos estadísticos para el análisis de las comunidades bacterianas.. Revisión de estudios empíricos, crítica y perspectivas.. Bibliografia.. CUARTA PARTE. LA ECOLOGÍA MOLECULAR DE PLANTAS Y ANIMALES.. Capítulo 13 . Ecología evolutiva de las zonas de hibridación.. Aspectos teóricos.. Estudios de zonas de hibridación en plantas y animales.. Bibliografía.. Capítulo 14. Filogeografía y vertebrados.. Algunos aspectos generales sobre filogeografía.. La molécula estrella, el ADN mitocondrial.. Teoría de coalescencia y métodos de análisis.. Filogeografía de vertebrados.. Filogeografía intraespecífica.. Filogeografía comparada.. Bibliografía.. Capítulo 15. Filogeografía de aves mexicanas.. Métodos y análisis de la filogeografía.. Estudios mexicanos.. Bibliografía.. QUINTA PARTE. LAS HERRAMIENTAS MOLECULARES.. Capítulo 16. Extracción de ácidos nucleicos.. ADN en el laboratorio.. ADN.. Protocolos de extracción de ADN implementados en el laboratorio de Evolución Molecular y Experimental del Instituto de Ecología.. Extracción de ADN de bacterias gram negativas.. Extracción de ADN en plantas.. Extracción de ADN en animales.. ARN.. Métodos de extracción del ARN.. Bibliografía

Capítulo 17. Guía práctica sobre la técnica de PCR.. Tipos de técnicas.. ¿Qué se necesita para hacer un PCR y cómo conseguir estos reactivo en México?.. Haciendo PCR: cómo hacerlo y algunos tips para que salga mejor.. Métodos para visualizar el PCR.. Recetas.. Bibliografía.. Capítulo 18. Breve revisión de los marcadores moleculares.. Variación morfológica y variación molecular.. Marcadores moleculares.. Isoenzimas/aloenzimas.. RAPDs.. Microsatélites.. ISSRs.. RFLPs.. AFLPs.. Secuenciación de ADN.. Microarrays (microarreglos.. Bibliografía.. Capítulo 19. Inter Simple Sequence Repeats (ISSRs.. Ventajas y desventajas.. Aplicaciones.. Bibliografía.. Índice analítico

La ecología molecular ha abierto la puerta al estudio de problemas fascinantes que hace pocos años nos parecían insolubles, y conforma un nuevo campo dentro de la biología que sugiere una síntesis entre los estudios poblacionales y los análisis evolutivos en un contexto ecológico. Este libro está dirigido a personas con interés en la ecología y la evolución, su objetivo es guiar a estudiantes y a científicos interesados en poder iniciar investigaciones dentro de este novedoso campo de estudio. Esta obra consta de 20 capítulos y abarca desde problemas teóricos avanzados hasta los detalles básicos experimentales sobre cómo realizar los muestreos adecuados a las preguntas que se requieren resolver o cómo solucionar problemas relacionados con las herramientas de la biología molecular. Se ha tratado que los estudios y los ejemplos que aquí se reúnen abarquen a todos los organismos presentes en nuestro planeta, desde bacterias y hongos hasta aves y mamíferos, pasando, obviamente, por todo tipo de plantas. spa