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Estructura genética de los manatíes en México / Coralie Nourisson Blas

Por: Nourisson Blas, Coralie [autor/a].
Morales Vela, José Benjamín [tutor] | McGuire, Peter M [asesor] | Escorza Treviño, Sergio [asesor] | Schmitter Soto, Juan Jacobo [asesor].
Tipo de material: Tesis
 impreso(a) 
 Tesis impreso(a) Editor: Chetumal, Quintana Roo, México: El Colegio de la Frontera Sur, 2011Descripción: 124 hojas : fotos, mapas ; 28 centímetros.Tema(s): Manatíes | Composición de la población | Genética animal | MicrosatélitesTema(s) en inglés: Manatees | Population composition | Animal genetics | MicrosatellitesDescriptor(es) geográficos: Campeche (México) | Chiapas (México) | Quintana Roo (México) | Tabasco (México) | Veracruz de Ignacio de la Llave (México) Clasificación: TE/599.550972 / N6 Nota de acceso: Acceso en línea sin restricciones Nota de disertación: Tesis Doctorado en Ciencias en Ecología y Desarrollo Sustentable El Colegio de la Frontera Sur 2011 Nota de bibliografía: Bibliografía: hoja 103-113 Conservación de la BiodiversidadNúmero de sistema: 50788Contenidos:Mostrar Resumen:
Español

El manatí antillano (Trichechus manatus manatus) vive en las aguas tropicales costeras de las Antillas Mayores y del Caribe, a lo largo de América Central y del Sur, desde México hasta Brasil. Históricamente, los manatíes fueron abundantes en México; sin embargo, su caza para consumo durante el periodo precolombino, la colonización española y a lo largo de la historia de México, resultó en una reducción significativa de la población. El manatí es una especie protegida a nivel nacional e internacional. Se distribuye a lo largo de las costas y de los sistemas lagunares de México desde el estado de Tamaulipas hasta Quintana Roo, con una estimación de 1000 a 2500 manatíes para todo México. Se admite que la diversidad genética de una población es un factor importante que permite la adaptación de las especies a nuevas condiciones ambientales. Los análisis de genética son una herramienta relativamente nueva que permite hacer inferencias en la biología, comportamiento, evolución e historia de vida de las especies y poblaciones. El objetivo de esta tesis de doctorado fue determinar la estructura genética de las poblaciones de manatíes en México mediante marcadores microsatélites. Se construyó una base de datos con el perfil genético o huellas digitales de ADN para la identificación de los manatíes mexicanos para contestar preguntas de estructura de población, identificación individual y pedigrí. Para lograr estos objetivos, 98 muestras fueron analizadas mediante 16 microsatélites. La identificación individual de cada animal con 16 microsatélites fue analizada con una alta resolución. Sin embargo, los 16 microsatélites no permitieron reconstruir el pedigrí de los manatíes en libertad. Además, incluso con 30 microsatélites la resolución no fue lo suficientemente fina para alcanzar un nivel óptimo para los análisis de pedigrí de los manatíes de cautiverio con un pedigrí conocido.

La estructura genética basada en microsatélites muestra la presencia de dos poblaciones en México: la del Golfo de México y la del Caribe, particularmente de la bahía de Chetumal, con una zona de mezcla de estas dos poblaciones en la bahía de la Ascensión, ubicada al norte de la bahía de Chetumal. Se encontró que las dos poblaciones tienen poca variabilidad genética. La diversidad genética más baja se encontró en el Golfo de México, la cual es la población más grande, y probablemente sea el resultado de una combinación de efecto fundador, ya que es el ámbito de distribución más al norte de la subespecie T. m. manatus, y de un cuello de botella. La diversidad genética más grande se encontró a lo largo de la costa del Caribe, la cual es también la población con un menor número de manatíes. Esta mayor diversidad posiblemente sea causada por manatíes provenientes del Golfo de México y de Belice. Existe evidencia de un flujo genético limitado o unidireccional entre estas dos áreas importantes. Los análisis presentados en esta tesis también sugieren evidencias iniciales de que probablemente existen unos pocos migrantes entre Florida y México. Para resolver asuntos de manejo, se recomienda considerar dos poblaciones de manatíes genéticamente distintas en México, una presente a lo largo de la costa del Caribe y otra en los sistemas lagunares asociados al Golfo de México.

Inglés

The Antillean manatee (Trichechus manatus manatus) occupies the tropical coastal waters of the Greater Antilles and Caribbean, extending from Mexico along Central and South America to Brazil. Historically, manatees were abundant in Mexico, but hunting during the pre-Columbian period, the Spanish colonization and throughout the history of Mexico has resulted in the significantly reduced population occupying Mexico today. The manatee in Mexico is a protected species at national and international levels. They are found along the coastal and riverine systems of Mexico from the states of Tamaulipas to Quintana Roo with a total estimate of 1000 to 2500 manatees. It is known that genetic diversity of a population is an important factor that allows the adaptation of a species to new environmental conditions. Genetic analysis is a relatively new tool that allows one to make inferences on the biology, behavior, evolution and life history of species and populations. The goal of this PhD thesis was to determine the genetic structure of the manatee population in Mexico using microsatellite markers. A data-base with the genetic profile, or DNA fingerprint, for the identification of manatees in Mexico was constructed to address questions of population structure, individual identity and pedigree. To achieve these goals, 98 samples were analyzed using 16 microsatellite markers. The individual identification of each animal with 16 microsatellites was performed at a high resolution. Nevertheless, the 16 microsatellites do not allow one to construct the pedigree of manatees in the wild. Furthermore even with 30 microsatellites, the resolution was not enough to reconstruct pedigree analysis for captive-born manatees with known pedigree histories.

The genetic structure, using microsatellites, suggests the presence of two populations in Mexico: the Gulf of Mexico and Chetumal Bay on the Caribbean Coast, with a zone of admixture in Ascension Bay. Both populations show low genetic diversity. The lower genetic diversity found in the Gulf of Mexico, the largest manatee population in Mexico, is probably due to a combination of a founder effect, as this is the northern distribution range of the subspecies of T. m. manatus, and a bottleneck event. The greater genetic diversity observed along the Caribbean coast, which also has the smallest estimated number of individuals, is possibly due to manatees that emigrate from the Gulf of Mexico and Belize. There is evidence to support limited or unidirectional gene flow between these two important areas. The analyses presented here also suggest minimal evidence of a handful of individual migrants possibly between Florida and Mexico. To address management issues we recommend considering two distinct genetic populations in Mexico, one along the Caribbean coast and one in the riverine systems connected to the Gulf of Mexico.

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Tesis Doctorado en Ciencias en Ecología y Desarrollo Sustentable El Colegio de la Frontera Sur 2011

Bibliografía: hoja 103-113

Agradecimientos.. Resumen y palabras claves.. Abstract and keywords.. Lista de contenido.. Índice de cuadros.. Índice de figuras.. Capítulo I - Introducción.. 1- Las especies de manatíes.. 2 - Importancia de la conservación de los manatíes.. 3 - Distribución histórica en México.. 4 - Distribución actual de los manatíes en México.. 5 - Estudios genéticos anteriores.. 6 - Importancia de la genética en la biología de la conservación.. 7 - Objetivos de la tesis.. Capítulo II - Utilización de marcadores microsatélites para la identificación individual de los manatíes.. 1 - Introducción.. 2 - Material y métodos.. Análisis genético.. Análisis estadístico.. 3 - Resultados y discusión.. 4 - Conclusión e implicación para el manejo y para los estudios futuros.. Capítulo III - Evidencia de dos grupos genéticos de manatíes con baja diversidad genética en México e implicaciones para su conservación.. 1 - Introducción.. 2 - Métodos.. Análisis de genética.. Análisis estadísticos.. 3 - Resultados.. Estructura poblacional.. Diversidad genética.. 4 - Discusión.. 5 - Conclusiones y aplicación para la conservación.. Capítulo IV - Estudios de pedigrí de los manatíes en cautiverio y de vida libre.. 1- Introducción.. 2 - Material y métodos.. Análisis de genética.. Reconstrucción de los pedigríes.. 3 - Resultados y discusión.. 4 - Conclusiones e impactos para la conservación de los manatíes y estudios futuros.. Capítulo V - Conclusiones e implicaciones para el manejo.. 1 - Identificación individual.. 2 - Estructura poblacional y diversidad genética.. 3 - Pedigrí.. Capítulo VI - Estudios futuros.. 1 - Microsatélites.. 2 - Genómica y transcriptómica

Capítulo VII - Producción científica.. 1 - Producción científica relacionada con el doctorado.. 2 - Presentación en conferencias con resumen publicado.. 3 - Participación en conferencia, simposio, talleres y clases.. 4 - Producción no relacionada con el doctorado.. Literatura citada.. Anexos.. Anexo 1: Extracción con fenol-cloroforma.. Anexo 2: Cuadro de los Alelos exclusivos y sus frecuencias.. Anexo 3: Forma genética apaisada interpolada (Interpolate genetic landscape shape construida con el programa ALLELE IN SPACE.. Anexo 4: Árbol genético de los pedigríes construidos con los resultados de la reconstrucción y de los conocimientos previos procurados por los acuarios.. Anexo 5: Reconstrucción de los pedigríes para los manatíes de cautiverio mediante la máxima verosimilitud (maximum likelihood de ML-Relate

Acceso en línea sin restricciones

El manatí antillano (Trichechus manatus manatus) vive en las aguas tropicales costeras de las Antillas Mayores y del Caribe, a lo largo de América Central y del Sur, desde México hasta Brasil. Históricamente, los manatíes fueron abundantes en México; sin embargo, su caza para consumo durante el periodo precolombino, la colonización española y a lo largo de la historia de México, resultó en una reducción significativa de la población. El manatí es una especie protegida a nivel nacional e internacional. Se distribuye a lo largo de las costas y de los sistemas lagunares de México desde el estado de Tamaulipas hasta Quintana Roo, con una estimación de 1000 a 2500 manatíes para todo México. Se admite que la diversidad genética de una población es un factor importante que permite la adaptación de las especies a nuevas condiciones ambientales. Los análisis de genética son una herramienta relativamente nueva que permite hacer inferencias en la biología, comportamiento, evolución e historia de vida de las especies y poblaciones. El objetivo de esta tesis de doctorado fue determinar la estructura genética de las poblaciones de manatíes en México mediante marcadores microsatélites. Se construyó una base de datos con el perfil genético o huellas digitales de ADN para la identificación de los manatíes mexicanos para contestar preguntas de estructura de población, identificación individual y pedigrí. Para lograr estos objetivos, 98 muestras fueron analizadas mediante 16 microsatélites. La identificación individual de cada animal con 16 microsatélites fue analizada con una alta resolución. Sin embargo, los 16 microsatélites no permitieron reconstruir el pedigrí de los manatíes en libertad. Además, incluso con 30 microsatélites la resolución no fue lo suficientemente fina para alcanzar un nivel óptimo para los análisis de pedigrí de los manatíes de cautiverio con un pedigrí conocido. spa

La estructura genética basada en microsatélites muestra la presencia de dos poblaciones en México: la del Golfo de México y la del Caribe, particularmente de la bahía de Chetumal, con una zona de mezcla de estas dos poblaciones en la bahía de la Ascensión, ubicada al norte de la bahía de Chetumal. Se encontró que las dos poblaciones tienen poca variabilidad genética. La diversidad genética más baja se encontró en el Golfo de México, la cual es la población más grande, y probablemente sea el resultado de una combinación de efecto fundador, ya que es el ámbito de distribución más al norte de la subespecie T. m. manatus, y de un cuello de botella. La diversidad genética más grande se encontró a lo largo de la costa del Caribe, la cual es también la población con un menor número de manatíes. Esta mayor diversidad posiblemente sea causada por manatíes provenientes del Golfo de México y de Belice. Existe evidencia de un flujo genético limitado o unidireccional entre estas dos áreas importantes. Los análisis presentados en esta tesis también sugieren evidencias iniciales de que probablemente existen unos pocos migrantes entre Florida y México. Para resolver asuntos de manejo, se recomienda considerar dos poblaciones de manatíes genéticamente distintas en México, una presente a lo largo de la costa del Caribe y otra en los sistemas lagunares asociados al Golfo de México. spa

The Antillean manatee (Trichechus manatus manatus) occupies the tropical coastal waters of the Greater Antilles and Caribbean, extending from Mexico along Central and South America to Brazil. Historically, manatees were abundant in Mexico, but hunting during the pre-Columbian period, the Spanish colonization and throughout the history of Mexico has resulted in the significantly reduced population occupying Mexico today. The manatee in Mexico is a protected species at national and international levels. They are found along the coastal and riverine systems of Mexico from the states of Tamaulipas to Quintana Roo with a total estimate of 1000 to 2500 manatees. It is known that genetic diversity of a population is an important factor that allows the adaptation of a species to new environmental conditions. Genetic analysis is a relatively new tool that allows one to make inferences on the biology, behavior, evolution and life history of species and populations. The goal of this PhD thesis was to determine the genetic structure of the manatee population in Mexico using microsatellite markers. A data-base with the genetic profile, or DNA fingerprint, for the identification of manatees in Mexico was constructed to address questions of population structure, individual identity and pedigree. To achieve these goals, 98 samples were analyzed using 16 microsatellite markers. The individual identification of each animal with 16 microsatellites was performed at a high resolution. Nevertheless, the 16 microsatellites do not allow one to construct the pedigree of manatees in the wild. Furthermore even with 30 microsatellites, the resolution was not enough to reconstruct pedigree analysis for captive-born manatees with known pedigree histories. eng

The genetic structure, using microsatellites, suggests the presence of two populations in Mexico: the Gulf of Mexico and Chetumal Bay on the Caribbean Coast, with a zone of admixture in Ascension Bay. Both populations show low genetic diversity. The lower genetic diversity found in the Gulf of Mexico, the largest manatee population in Mexico, is probably due to a combination of a founder effect, as this is the northern distribution range of the subspecies of T. m. manatus, and a bottleneck event. The greater genetic diversity observed along the Caribbean coast, which also has the smallest estimated number of individuals, is possibly due to manatees that emigrate from the Gulf of Mexico and Belize. There is evidence to support limited or unidirectional gene flow between these two important areas. The analyses presented here also suggest minimal evidence of a handful of individual migrants possibly between Florida and Mexico. To address management issues we recommend considering two distinct genetic populations in Mexico, one along the Caribbean coast and one in the riverine systems connected to the Gulf of Mexico. eng

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