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En este estudio se analizó la distribución textural estacional y espacial de los sedimentos superficiales y el contenido de carbono orgánico (C.O.) en ellos en el sistema costero Chantuto-Panzacola durante el período de 1997 a 2003. Los sedimentos superficiales se colectaron en 10 estaciones de muestreo con una draga tipo van Veen (3L). Se determinó el carbono orgánico (C.O.%) y se analizó la distribución textural (arena, limo, arcilla) con el método del pipeteo. Hubo diferencias significativas de C.O. en los sedimentos entre las estaciones de secas y de lluvias. El contenido de C.O. fue mayor en los meses asociados a la época de lluvias, mostrando que el aporte de C.O. proviene de fuentes tanto autóctonas, como alóctonas (por medio de la descarga fluvial). La distribución espacial de C.O. a través de las lagunas fue mayor principalmente en la E4 (Chantuto) - E6 - E5 (Panzacola), mientras que en la E1 (en la boca con influencia marina) fue mucho menor debido al flujo de agua de mar que mantiene en suspensión la materia particulada. La distribución del tamaño de grano fue muy heterogénea entre años, épocas climáticas y estaciones en las lagunas ya que varió de limo-arenoso y arena-limo-arcilloso a arcilla-arenosa. El efecto de la tormenta tropical "Javier" de septiembre de 1998 fue significativo, con un incremento en la proporción de arenas y disminución del C.O. en casi todo el sistema lagunar. Para el año 2003, el porcentaje de C.O. fue similar al de 1997, sin embargo, la granulometría continúa modificándose, sobre todo en las áreas donde se han realizado dragados desde el año 2001.